股權糾紛主要分為四類：股東出資糾紛、股權確認糾紛、股權轉讓糾紛、股東權利糾紛等。

股東出資糾紛

股東出資糾紛是股東在公司設立過程或增資過程中，因履行向公司投入資金或物等資本過程中所發生的糾紛。

在司法實踐中，股東出資糾紛主要有：

一、股東虛報出資額，有關驗資單位出具虛假的驗資證明，使不符合條件的“公司”得以登記；

二、先出資后抽逃，公司發起人在設立時，通過借款等方式籌措資金劃到驗資帳戶上，一旦完成驗資后，即以各種形式將資本進行抽逃。

股權確認糾紛

股權確認實質上就是股東資格的確認。在司法實踐中，因股東資格而產生的股權確認之訴是較為常見的一種糾紛和訴訟，也是在法理上合實務中較為復雜的訴訟。股東資格的認定問題主要存在于有限責任公司，股份有限公司股東資格以是否持有公司發行的股票為認定標準，一般不存在疑義。

股權轉讓糾紛

股權轉讓糾紛是指股權在轉讓的過程中所發生的糾紛的總稱，包括股東之間轉讓股權的糾紛，以及股東與非股東之間轉讓股權的糾紛   。

股東權利糾紛

股東權利糾紛是指在按公司法注冊的企業中，企業財產的一個或多個權益所有者擁有哪些權利和按什么方式、程序來行使權利過程中所發生的糾紛。